《輔行訣》將疾病分成三大類，相應(yīng)地給予三大類對應(yīng)處方。第一大類是普通的外感病和內(nèi)傷雜病，分別稱之為時恙和夙痼，相對簡單。第二大類疾病是外感天行病，比較復(fù)雜，對人類健康威脅較大。實(shí)際上，外感天行病，又稱時行疫氣病，是因?yàn)榭瓦\(yùn)、客氣導(dǎo)致地球氣候異常，物候、病候等隨之異常，從而在地球上的生物（人類、動物、植物）之間發(fā)生了不同規(guī)模的傳染病。大量臨床實(shí)踐證明，中醫(yī)界治療傳染病最常用的還是傷寒方和溫病方，但臨床總有遺憾之時，而在這方面，《輔行訣》的體系可資借鑒。《輔行訣》的核心是六合辨證、二旦四神湯；《傷寒論》的核心是六經(jīng)辨證，經(jīng)方113個；《輔行訣》的二旦四神湯與《傷寒論》的數(shù)個核心方基本相同。顯而易見，《輔行訣》與《傷寒論》具有某種傳承同源性，具有極大學(xué)術(shù)價值。這個同源性，可能是《湯液經(jīng)法》與《黃帝內(nèi)經(jīng)》的某種融合，是古代中醫(yī)各學(xué)術(shù)派別之間的交織秘辛，在本書的引領(lǐng)下，追本溯流，或可博極醫(yī)源，執(zhí)簡馭繁。