全書分四部分：甲午戰(zhàn)爭準(zhǔn)備即備戰(zhàn)、陸戰(zhàn)、海戰(zhàn)、外交戰(zhàn)等。其中陸戰(zhàn)部分包括參謀總長發(fā)布的第1至第346號作戰(zhàn)命令及大本營其他命令、第一軍與第二軍的作戰(zhàn)詳報(bào)及作戰(zhàn)報(bào)告與電報(bào)等，海戰(zhàn)包括大本營命令第1至239號、大海報(bào)(海報(bào))、臺海報(bào)及大本營日記等。編入本書文獻(xiàn)的都是日本軍部即陸軍省、海軍省、參謀本部和軍令部的原始檔案，全部是手寫件。日本軍部檔案，美軍占領(lǐng)日本時(shí)全部掠回國內(nèi)，制成縮微膠卷存放在美國國會圖書館歷史縮微中心，原件于上個世紀(jì)五十年代交還日本，保留在日本防衛(wèi)廳防衛(wèi)研究所。本書是“九一八”歷史博物館投入大量人力與財(cái)力，歷經(jīng)三年多時(shí)間，從日本軍部檔案中反復(fù)遴選的甲午戰(zhàn)爭機(jī)密軍事檔案編輯而成。《日本軍部甲午戰(zhàn)爭機(jī)密檔案匯編》擬分集出版，甲午戰(zhàn)爭130周年前出齊。本書是研究甲午戰(zhàn)爭歷史必備的原始檔案史料。