本圖鑒收載水生維管植物60科152屬254種。植物科的排列，蕨類植物按照秦仁昌系統(tǒng)(1978)、裸子植物按照鄭萬鈞系統(tǒng)(1978)、被子植物按照APG IV(2016)分別進行；科內(nèi)屬的排列，按照屬拉丁名稱的首字母順序進行；屬內(nèi)物種的排列，以種加詞拉丁名稱的首字母順序進行。每種植物的文字內(nèi)容包括俗名、分類學(xué)地位、關(guān)鍵識別特征、生境與分布和價值與應(yīng)用，另附有多幅精美照片和部分憑證標(biāo)本照片，力爭做到圖文并茂、科學(xué)性和通俗性相統(tǒng)一。