第1章　代謝組學概述　 001
1.1　非靶向代謝組學 　 003
1.2　靶向代謝組學 　 011
1.3　擬靶向代謝組學 　 014
參考文獻 　 017

第2章　代謝組學的基本操作　 019
2.1　樣本前處理 　 020
2.2　樣本檢測 　 024
2.3　數(shù)據預處理及統(tǒng)計分析 　 032
2.4　生物標記物的篩選 　 040
2.5　化合物鑒定 　 041
2.6　代謝組學研究中常用的數(shù)據庫 　 048
2.7　代謝組學活性篩選 　 057
2.8　小分子代謝物如何發(fā)揮重要功能 　 059
2.9　活性小分子代謝物的篩選方法 　 063
參考文獻 　 065

第3章　代謝組學研究中應記錄的關鍵信息　 069
3.1　樣品前處理 　 070
3.2　樣本檢測 　 072
3.3　數(shù)據預處理與統(tǒng)計分析 　 073
3.4　化合物鑒定 　 075
3.5　化合物命名 　 076
3.6　小結 　 078
參考文獻 　 079

第4章　代謝組學相關資料　 080
4.1　有助于實驗設計的參考文獻 　 081
4.2　代謝組學實驗中應該如何做選擇？ 　 081
4.3　質譜相關知識 　 083
4.4　高分辨液質聯(lián)用技術的發(fā)展 　 090
4.5　質譜使用注意事項 　 095
4.6　代謝組學數(shù)據處理時如何去除外源性物質干擾 　 096
4.7　實驗過程中需要注意的問題 　 097
4.8　送公司測試樣本 　 102
參考文獻 　 105

第5章　代謝組學常用軟件操作　 107
5.1　如何用 Origin軟件畫質譜圖 　 108
5.2　SIMCA軟件操作 　 117
5.3　MetaboAnalyst軟件操作 　 123
5.4　HemI軟件操作 　 137
5.5　MS-DIAL軟件操作 　 142
5.6　 MZmine2軟件操作 　 151

第6章　總結　 166
6.1　代謝組學并不神秘 　 167
6.2　代謝組學的學習過程 　 169

附錄　172
附錄一　代謝組學知識框架圖 　 173
附錄二　血液樣本的代謝組學研究方法 　 174
附錄三　尿液樣本前處理方法 　 175
附錄四　組織樣本前處理方法 　 175
附錄五　代謝組學樣本前處理和分析方法 　 176